工伤伤害一般由申请的单位或者申请的职工一方举证。但如果职工或者其近亲属认为是工伤，用人单位不认为是工伤的，则由用人单位向受理申请的行政部门承担举证责任。
当发生职业伤害事故后，有些企业为了逃避工伤保险责任，会毁掉有关劳动关系的证明，并极力否认存在事实劳动关系，从而造成受害者因无法证明劳动关系而遭遇索赔困境的情况时有发生。有很多受伤职工自己去申请工伤认定，在向劳动保障部门申请工伤时，拿不出与用人单位存在劳动关系的证明材料，而大多数劳动保障部门在个人申请工伤认定程序上要以劳动合同为证明才肯受理，这将直接影响到伤害能否认定为工伤，以及确认工伤责任的最终承担者。
要追索劳动权益，证明劳动关系是必要的，但若要求处于弱势一方的劳动者举证，显然增加了解决问题的难度。到底应该由谁来证明劳动关系呢?企业(用人单位)对劳动关系的证明负有举证责任，这是由工伤认定适用举证责任倒置原则所决定的。工伤认定坚持举证责任倒置原则是非常合理和必要的。实行“谁主张，谁举证”原则，对一般的诉讼是适合的;但是，在工伤认定中则不适合。原因主要有两点：
一是在用人单位与职工之间，单位处于管理者的位置，职工对单位具有依附性和从属性。许多人的文书、文件是由用人单位拟定并掌管的，如职工花名册、工资表等，而工伤认定中的纠纷，往往涉及到这些材料的举证。如果按照“谁主张、谁举证”原则，那么职工个人的许多主张都难以得到充分的证明，这会导致职工工伤权益受损。因此，为了保护职工作为弱势者的合法权益，在发生工伤认定时，必须要由用人单位承担举证责任。
二是用人单位否认存在劳动关系，可以达到逃避工伤赔偿责任的目的。根据《工伤保险条例》规定，用人单位参加工伤保险，职工受工伤的待遇由劳动和社会保障行政部门承担;相反，用人单位的职工若没有参加工伤保险，职工受工伤的待遇由用人单位按条例的标准进行赔偿。因此，当发生工伤事故时，一些企业，特别是没与职工签订劳动合同的企业，为了逃避工伤赔偿责任，会极力否认与劳动者存在劳动关系。为了保护劳动者的合法权益，由用人单位(企业)承担举证责任是必要的。
法律依据
《工伤保险条例》
第十九条 劳动保障行政部门受理工伤认定申请后，根据审核需要可以对事故伤害进行调查核实，用人单位、职工、工会组织、医疗机构以及有关部门应当予以协助。职业病诊断和诊断争议的鉴定，依照职业病防治法的有关规定执行。对依法取得职业病诊断证明书或者职业病诊断鉴定书的，劳动保障行政部门不再进行调查核实。
职工或者其直系亲属认为是工伤，用人单位不认为是工伤的，由用人单位承担举证责任。
第二十条 劳动保障行政部门应当自受理工伤认定申请之日起60日内作出工伤认定的决定，并书面通知申请工伤认定的职工或者其直系亲属和该职工所在单位。
劳动保障行政部门工作人员与工伤认定申请人有利害关系的，应当回避。
